Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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UBE3CQ15386 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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UBE3CQ15386 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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UBE3CQ15386 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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UBE3CQ15386 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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UBE3CQ15386 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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UBE3CQ15386 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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