Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
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PTPRKQ15262 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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