Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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