Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC3Q15034 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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