Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIXQ14938 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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