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| NAE1 | Q13564 | AC093879.1-201 | ENST00000508959 | 1176 nt | TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC025674.2-201 | ENST00000522622 | 2971 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP003068.1-201 | ENST00000528887 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | CUL7-203 | ENST00000535468 | 5504 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | COL25A1-201 | ENST00000399126 | 2674 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.7 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | HEATR3-201 | ENST00000299192 | 3560 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC022137.2-201 | ENST00000503482 | 481 nt | BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPDYE16-201 | ENST00000515340 | 858 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | EFHC1-212 | ENST00000635984 | 3293 nt | TSL 5 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC023090.2-201 | ENST00000625182 | 2110 nt | BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MROH1-209 | ENST00000534366 | 5092 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | GPD1L-201 | ENST00000282541 | 4060 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MSTO2P-201 | ENST00000314835 | 1709 nt | BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | TSC2-203 | ENST00000382538 | 5264 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | KCNC1-201 | ENST00000265969 | 4295 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC018442.1-201 | ENST00000421439 | 2061 nt | BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | HM13-201 | ENST00000335574 | 1809 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.69 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | FGD2-201 | ENST00000274963 | 3046 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | GPER1-201 | ENST00000297469 | 2778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | CELF4-223 | ENST00000603232 | 1906 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | FECH-202 | ENST00000382873 | 2526 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCDC140-201 | ENST00000295226 | 1699 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | RTN4IP1-201 | ENST00000369063 | 1682 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | EFNB1-201 | ENST00000204961 | 3314 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | JPH1-201 | ENST00000342232 | 4378 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
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| NAE1 | Q13564 | HENMT1-202 | ENST00000370032 | 1874 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | B9D1-201 | ENST00000261499 | 908 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCGN-201 | ENST00000334979 | 704 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | B9D1-203 | ENST00000395615 | 805 nt | TSL 3 BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
| NAE1 | Q13564 | ACTBP8-201 | ENST00000403258 | 1108 nt | BASIC | 14.68 | □□□□□ -0.06 | | |
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