Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NAE1Q13564 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NAE1Q13564 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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