Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms