Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXC1Q12948 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXC1Q12948 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXC1Q12948 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXC1Q12948 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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