Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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