Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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