Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms