Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms