Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms