Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms