Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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