Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms