Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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