Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTHL1P78549 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms