Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms