Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PBX2P40425 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms