Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms