Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms