Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT1P26358 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms