Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms