Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDELR1P24390 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms