Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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