Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SPRR1BP22528 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms