Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1P21675 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms