Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms