Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms