Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms