Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIP12755 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIP12755 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIP12755 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms