Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEFHP12036 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms