Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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