Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCGP05129 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms