Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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