Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NOTOA8MTQ0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms