Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXD3Q9UJU5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXD3Q9UJU5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXD3Q9UJU5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXD3Q9UJU5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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