Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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