Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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USP35Q9P2H5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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USP35Q9P2H5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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