Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT82Q9NSB4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms