Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms