Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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