Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHOJQ9H4E5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms