Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms