Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXP3Q9BZS1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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