Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms