Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms