Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC4A5Q9BY07 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms