Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms